M. Kimoto, I. Hirao, Genetic Alphabet Expansion of Nucleic Acids. In Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids. (ed. Naoki Sugimoto) (Springer, 2023).

平尾一郎、８．遺伝情報の拡張、’核酸科学ハンドブック’ 杉本直己編、pp.398-402 (2020)、講談社．

M. Kimoto and K. Kawai, Molecular Technology toward Expansion of Nucleic Acid Functionality. Chapter 8, 165-181. In Molecular Technology, Volume 2: Life Innovation. (eds. Hisashi Yamamoto and Takashi Kato, Wiley-VCH, 2019)

M. Kimoto, R. Yamashige, I. Hirao, Site-specific fluorescent labelling of nucleic acids by genetic alphabet expansion using unnatural base pair systems. In Fluorescent analogs of biomolecular building blocks. (ed. Marcus Wilhelmsson and Yitzhak Tor) 297-319 (John Wiley & Sons; 2016).

平尾一郎、第10章　遺伝情報の拡張技術（人工塩基対）による機能性核酸の創出．’核酸医薬の創製と応用展開’　監修：和田猛、シーエムシー出版、pp. 87-95 (2016).

M. Kimoto, K. Matsunaga, Y. T. Redhead, I. Hirao, Genetic Alphabet Expansion by Unnatural Base Pair Creation and Its Application to High-Affinity DNA Aptamers. In Modified Nucleic Acids. Nucleic Acids Mol. Biol. 31, (ed. K. Nakatani, Y. Tor) 249-268 (Springer, 2016)

I. Hirao, Synthetic Genetic Polymers Functioning to Store and Propagate Information by Genetic Alphabet Expansion. In Synthetic Biology, Ad. Mol. Biol. Med., (ed R.A. Meyers) vol. 2, 505-521 (Willey-VCH, 2015).

平尾一郎、私のメンター・Andrew D. Ellington－核酸アプタマーを開発した直球勝負の研究者、実験医学、33 (3) 2月号 pp.505-508 (2014)、羊土社．

平尾一郎、木本路子、Campus & Conference探訪記・新大陸“Xenobiology” をめざして、実験医学、32 (13) 8月号 pp. 2176-2178 (2014)、羊土社.

M. Kimoto, I. Hirao, Creation of unnatural base pair systems toward new DNA/RNA biotechnologies. In Chemical Biology of Nucleic Acids, Fundamentals and Clinical Applications. (ed V.A. Erdmann, W.T. Markiewicz, J. Barciszewski) 131-148 (Springer Heidelberg New York Dordrecht London; 2014).

平尾一郎、人工塩基を用いてDNAの機能向上を達成. ‘化学 6月号’ 化学掲示板、vol. 68, p. 72 (2013).

平尾一郎、第6章. 人工DNAの合成生物学. ‘生命システム工学’ 田口精一 編、化学同人、pp. 101-128 (2012). 

I. Hirao, M. Kimoto, A synthetic biology approach to the expansion of the genetic alphabet: Molecular design of unnatural base pairs of DNA. TCIMAIL, 148, 2-10 (2012).

平尾一郎、胡桃坂仁志 編、‘核酸実験の原理とプロトコール’ 羊土社、(2011). 

I. Hirao, M. Kimoto, Expansion of the genetic alphabet in nucleic acids by creating new base pairs. In The Chemical Biology of Nucleic Acids. (ed Günter Mayer) 39-62 (Wiley-VCH, Weinheim; 2010).

I. Hirao, T. Kanamori, T. Ueda, Cell-free synthesis of proteins with unnatural amino acids. The PURE system and expansion of the genetic code. In Protein Engineering. (eds C. Köhrer, U. L. RajBhandary) 271-290 (Springer, Berlin, Heidelberg; 2009).

平尾一郎、第6章 1.アカデミックな場での研究者. ‘科学者ってなんだ？’ 梶雅範 編、丸善、pp. 76-88 (2007).　

平尾一郎、人工塩基対システムの開発：機能性RNAの創製を目指して. ‘機能性 Non-coding RNA’ 河合剛太、金井昭夫 編、 クバプロ、pp. 237-250　(2006).

平尾一郎、汎用性の高い人工塩基対を応用した高機能バイオポリマーの開発.　‘日経サイエンス：ゲノムサイエンスの新潮流’　5月号、p. 102 (2005).

平尾一郎、ポリメラーゼ認識能をもつ人工塩基対.　‘ゲノムケミストリー’関根光雄、斉藤烈編、講談社、pp. 174-187（2003）

平尾一郎、「11.5人工変異の導入法、11.7 UVによる架橋法」日本生化学会編、基礎生化学実験法、第４巻 核酸・遺伝子実験（応用編）、渡辺、水野編、東京化学同人（2000年発刊予定）

平尾一郎 & 菅裕明、「II. RNAの機能構造、2. 機能性RNAの創製」、RNA研究の最前線、志村、渡辺編、シュプリンガー・フェアラーク pp. 32-48（2000）
生物学事典、第4版、八杉、小関、古谷、日高編集、岩波（1996）

平尾一郎、「DNA化学合成法」、新基礎生化学実験法7、遺伝子工学、中嶋、野本、松橋、三浦、村松編、丸善（1988)